根据一般情况，南京毕业生的档案存放在毕业生所就读的高校或教育机构。学校或机构负责管理和保存学生的档案，在学生毕业后通常会将档案归档存放。如果南京毕业生转学或离校后，档案可能会由前学校或机构转交给新的学校或由教育局或档案馆统一管理。具体档案存放的地点可以咨询所毕业学校的教务办公室或档案管理部门。
根据一般情况，南京毕业生的档案存放在毕业生所就读的高校或教育机构。学校或机构负责管理和保存学生的档案，在学生毕业后通常会将档案归档存放。如果南京毕业生转学或离校后，档案可能会由前学校或机构转交给新的学校或由教育局或档案馆统一管理。具体档案存放的地点可以咨询所毕业学校的教务办公室或档案管理部门。