根据南通如东自主系统的规定，办理个体工商户需要缴纳一定的费用，具体费用标准可咨询当地工商部门或查询相关信息。根据南通如东个体工商户自主系统的要求，准备好相应的申请材料，包括身份证复印件、营业执照照片、经营场所租赁合同等。提交申请后，南通如东个体工商户自主系统会对申请材料进行审核，审核通过后会发放个体工商户营业执照。根据南通如东的税务部门规定，申请人需要到当地税务部门办理税务登记手续。
办理南通如东个体工商户自主系统办照的流程一般如下：
1. 登录南通如东个体工商户自主系统网站，进入系统。
2. 注册账号，填写个体工商户基本信息，包括商户名称、法定代表人、经营范围等。
3. 缴纳相关费用。根据南通如东自主系统的规定，办理个体工商户需要缴纳一定的费用，具体费用标准可咨询当地工商部门或查询相关信息。
4. 提交申请材料。根据南通如东个体工商户自主系统的要求，准备好相应的申请材料，包括身份证复印件、营业执照照片、经营场所租赁合同等。
5. 等待审核。提交申请后，南通如东个体工商户自主系统会对申请材料进行审核，审核通过后会发放个体工商户营业执照。
6. 领取营业执照。审核通过后，持申请人的身份证原件和审核通过通知书到南通如东工商局领取个体工商户营业执照。
7. 办理税务登记。根据南通如东的税务部门规定，申请人需要到当地税务部门办理税务登记手续。
8. 开展经营活动。办理完个体工商户营业执照和税务登记后，即可正式开展经营活动。
请注意，具体办理流程可能会因地区、政策等因素而有所不同，建议您在办理前仔细咨询当地工商部门或查询南通如东个体工商户自主系统的相关规定。