党组织负责管理和维护党员档案的完整性和保密性。需要注意的是，无论选择哪个地方存放党员档案，都应当保证档案的安全性和机密性，确保档案内容不被泄露。此外，还应定期对档案进行整理、归档和备份，以便随时查阅和使用。
西安高校毕业生党员档案应该放在以下地方：
1. 党组织：毕业生党员档案可以放在高校或毕业生所在党组织内部的档案室或党员档案室。党组织负责管理和维护党员档案的完整性和保密性。
2. 毕业生就业指导中心：毕业生就业指导中心可以设立专门的档案室或档案柜来收纳毕业生党员档案，并与高校党组织保持紧密联系，确保档案的安全和完整。
3. 人事档案室：毕业生的党员档案也可以放在高校的人事档案室中，与其他相关的人事档案一起管理，确保档案的一体化管理和统一存放。
需要注意的是，无论选择哪个地方存放党员档案，都应当保证档案的安全性和机密性，确保档案内容不被泄露。此外，还应定期对档案进行整理、归档和备份，以便随时查阅和使用。